Arranca la maquina con los dos botones del mouse presionados, hasta que aparezca la pantalla de setup, ahi pones "Boot With No Startup-Sequence", la maquina arranca en el shell, ahi tipeas:

ed s:user-startup

Con eso editas el archivo de arranque donde se suelen instalar todos esos programas, busca alguna parte que diga ide-fix, y ponele ; al inicio de cada linea, graba el archivo desde el menu, cerralo y luego reinicia a ver si arranca.

Muchas gracias Jorge, pero no hay ninguna línea que haga mención a algo de IDEFIX. Si la hay de Asimcdfs, le puse ; pero nada, sigo viendo todo negro.
Me parece que voy a reinstalar todo desde cero, mal que me pese.

Es raro que quede en la pantalla negra, podes transcribir las primeras lineas del startup-sequence?

Fijate si podes adjuntar startup-sequence y user-startup aca, en OS2.x para arriba no se usa startup-sequence, salvo para cosas muy criticas como aceleradoras, pero la norma es que todo programa, incluso los drivers, se instalan en user-startup.

Última parte:

En la primera foto que pusiste sale el IDEFix, donde dice:

Set SCSIUpdate 1
If EXISTS C:IDEFix
     C:IDEFix
     Set SCSIUpdate 0
EndIf

Ponele ; en las dos lineas:

;      C:IDEFix
;      Set SCSIUpdate 0

A ver si es eso, por ahi sea toda la seccion de SCSIUpdate 1. Yo creo que debes tener varios drivers que acceden a lo mismo y estan en conflicto.
Por otro lado, podes arrancar con el diskette de WB3.1, luego meter el diskette de Storage, buscar en DOSDrivers el icono PCO, hacer doble click, luego ya podes formatear un diskette en PC 720K donde podes grabar los archivos para pasarlos a la PC y adjuntarlos aca. Acordate de taparle el hueco indicador de alta densidad, o busca un diskette de doble densidad.

Muchas gracias!!!, funcionó. Bah, pude entrar al entorno gráfico del OS 3.9, pero, por supuesto el cdrom sigue sin funcionar
Si se te ocurre algo, soy todo oídos!
Gracias nuevamente.