Respuestas: 

1-  Si bien, se programar Basic, desde el aspecto básico del lenguaje, según algunos mas conocedores, y que realmente programaron cosas importantes para ambas maquinas, se dice que es mejor el Basic de Atari 8Bits, conozco gente que han comprado una Atari 8bit, sólo para programarla en Basic, por dicen que es una maquina genial para programar. Sin embargo, en Commodore 64, se puede programar en Esamblador, y las posibilidades (está demostrado con varios miles programas y juegos) son infinitas. 

2-La verdad que en cuanto a versatilidad, actualmente, se ha demostrado, gracias a los usuarios entusiastas, que tanto en 8Bits o 16bits, pueden tener la misma vesatilidad. Sorprende mas, cuando se trata de una maquina con recursos muy limitados, logrando funciones, que jamás se habrían pensado en los años 80. Por lo que, básicamente, depende del gusto personal, y sus preferencias, 8 o 16 bits.

3- Tengo una Commodore 128 que está por cumplir 30 años de acompañarme. Con esa maquina, he hecho de todo durante ese tiempo. Sin embargo, estuvo también en paralelo Amiga, que hasta el año 2010, siempre dije, era mi "maquina principal" (con una A1200, que tengo justamente aquí, a mi lado). 

4- Sin lugar a dudas, Amiga. Si bien, Atari tiene algunas cosas interesantes, me da la sensación de que siempre le falta 10 centavos para el peso.

En cuanto a que sistema sería mas ambicioso. Yo pienso que, la línea de Atari 8Bit era una gran maquina, el único problema, es que no desarrollaron  buen software. Pero, si te das "un paseo", por lo que hay para esa plataforma, se lograrán descubrir, que hubo algunos pocos, que si produjeron software a conciencia, logrando explotar el potencial de la maquina; mostrando que no hay nada que envidiar a la Commodore 64. Pero, reitero, el problema, fue lo poco que salió para la maquina y lo que hay, es dentro de: "Regular" a "Mediocre",  "Malo" y "extremadamente malo". Con lo cual, serían un buen desafío, programar y desarrollar algo bueno, para Atari 8Bit. 
Si es en 16Bit, Amiga.