Estuve viendo que hay unas cuantas implementaciones de Unix para Amiga, entre ellas la mas prometedora parece ser OpenBSD, que aparentemente es la mas moderna (actualizada hasta alrededor de 1998) con soporte para maquinas AGA y unas cuantas placas de expansion, como las Cybervision64, la EGS Spectrum y la placa de red Ariadne. 
Esta es la pagina: LINK
Estuve mirando la pagina de Minix y si bien requiere nada mas que una A500 con 1MB para correr, no tiene soporte de disco rigido.
Aparentemente hay una version de Debian 68K que soporta Amiga pero no la pude encontrar.
Pero leyendo un poco el manual de la Amiga 3000 para ver que tipo de memoria soporta, me encontre con que tiene 32 slots para memoria zip, que pueden ser de 256Kx4 o de 1Mx4, esto es memoria de 4 bits, lo cual implica que se necesita expandir de a 8 zips para tener los 32 bits de bus de datos requeridos por la 3000 (4 bits x 8 = 32 bits). La memoria fast en la placa madre esta dividida en 4 bancos de 8 zips cada uno. Con 8 zips de 256Kx4 se tiene 256Kx32 (memoria de 32 bits) lo cual traducido a bytes seria 1MB (porque cada direccion de los 256Kx32 contiene 32 bits y eso equivale a 4 bytes), y con 8 zips de 1Mx4 se tiene 1Mx32 que en bytes serian 4MB, todo esto por cada banco, lo cual significa que con los de 256Kx4 se puede alcanzar un maximo de 4MB y con los de 1Mx4 un maximo de 16MB.
Por lo que lei en el manual las 3000 venian de fabrica con 1MB fast pero en chips DIP, supongo que esto puede haber cambiado en los ultimos tiempos y haber venido directamente con zips despues. El manual dice que los 8 zocalos DIP son electricamente equivalentes al banco 0 de zips, lo cual me hace pensar si no sera posible colocar chips de RAM para completar los 4MB, es decir chips de 1Mx4, y trasladar al banco 1 los 4MB en zips que vienen en todas las 3000 de las cuales tengo conocimiento, si esto se puede hacer tendriamos 8MB y no habria necesidad inmediata para completar los 16MB (es decir, podriamos esperar un par de dias mas para eso  ;D)
Ahora, no hay constancia de que se puedan poner chips de 1Mx4, ya que la maquina venia con los de 256Kx4, pero dudo que hayan hecho un circuito diferente para el banco DIP y el zip, asi que creo que tiene bastantes posibilidades de funcionar. 
Correccion: el manual dice especificamente que se pueden poner chips DIP de 1Mx4 en el banco 0 y zips de 1Mx4 en los bancos 1, 2 y 3. 
Hace meses que no abro ni enciendo las dos A3000 que tengo, pero revisando las fotos detalladas que le tome a las dos placas madre justamente para no tener que abrirlas, veo que tienen el jumper colocado para usar memorias de 1Mx4, y tienen 16 zips colocados, esto significa que tengo 8MB fast en cada una 
Cuando las probe me parecio que tenian 4MB, voy a tener que revisar de nuevo, porque o vi mal o tengo zips de memoria que no estan andando.

Recuerdo que la 3000 venia con 1mb de chip ram y zocalos para otro mega extra, este ultimo mega salia de las dips que traia de fabria en fast ram, al colocar el mega que traia en fasta ram (en dips) en la chip ram, ahi recien se podia colocar las zips (asi hice en aquella epoca). Y tengo la certeza que no se podia mezclar en la fast ram, dips y zip. Pero es solo el recuerdo que tengo.
Saludos

passtbytes es el acopiador de memorias zip!

El manual dice que se pueden poner 4MB en chips DIP y los otros 12MB en zips en los bancos 1 a 3. Da el ejemplo diciendo que se puede sacar el MB fast en chips DIP, ponerlo como el segundo MB chip, y colocar chips DIP de 1Mx4 en el banco 0 de fast RAM, y zips de 1Mx4 en los otros 3 bancos. Asi que si tenes 4MB en zips podes llevarla a 8MB consiguiendo 8 chips DIP de 1Mx4, y en mi caso si tengo 8MB podria llevarla a 12MB con el mismo procedimiento. Logicamente que hay que mover los zips dejando el banco 0 libre.

Con las memos que tengo llego a 2MB, asi que no me sirve tampoco 
Tengo que comprar otra A3000!!! 

Edito: mis chips disponiblers dicen 4256, saque bien la cuenta no?

Habra que saquear placas de PC, no se en que placas pueden venir esos chips, 4MB es mucha memoria para la epoca en que se usaban DIP. No se si en alguna 286 venian chips de 1Mx4, no me fije que tipo de chips tenia la placa 286 a la que le robe los chips de los 2MB de RAM que traia, ahora estan en una placa SCSI+RAM en la A2000, tendria que abrirla para ver que chips son, pero se me hace que deben ser los de 256Kx4 u otros similares. De todas maneras siempre tenemos a ebay, es posible que en expansiones de memoria ISA para PC (que aca no se vendian) pueda llegar a haber 4MB en chips de 1Mx4, no creo que sea imposible conseguirlos, solo hay que investigar donde se usaron, como sea seguro que es mas posible que conseguir zips.
Estuve revisando las 3 bridgeboards que tengo y hay una mezcla de zips de 1Mx4 y 256Kx4, ya que a diferencia de la 3000, estas placas permiten colocar tipos diferentes de zips en cada uno de los 4 bancos.
En total tengo:
8 zips de 1Mx4 (4MB) + 8 zips de 1Mx4 (4MB) + 4 zips de 1Mx4 (2MB) = 10MB
8 zips de 256Kx4 (1MB) + 8 zips de 256Kx4 (1MB) = 2MB
Es menos memoria de lo que esperaba asi que no creo que me sobre nada que sea util, esas placas permiten un maximo de 8MB asi que al menos una va a tener eso (en zips que serian utilizables en la 3000), lo cual es logico para una 386 (tambien existen unos adaptadores de SIMM a zip que permitirian usar 16MB), en otra placa quedarian 2MB (que igual en una 3000 no serian utilizables porque son 4 zips y la 3000 expande de a 8, esta es una 386sx asi que requiere 4 zips, es decir 16 bits, no 32 como la 3000), y en la ultima placa otros 2MB pero con los 16 zips de 256Kx4.
Volviendo a la 3000, el manual te da ejemplos de marcas y modelos de chips DIP que podrian servir para expandir la memoria, tenes el manual?

Si tengo el manual (que mala costumbre que tengo de no leer el manual). En cuanto al adaptador que mencionas, hice un post en el foro de hardware al respecto hace unos dias, tratare de armar uno ahora en mis vacaciones.
Saludos!

Lo que dice aca (http://bboah.amiga-resistance.info/cgi-bin/showhardware_en.cgi?HARDID=22) contradice lo del manual... 

Debian 4.0 para 68k
http://people.debian.org/˜cts/debian-m68k/etch/
Es una punta para empezar...