Nueva data al respecto por si alguien se tomo el atrevimiento:

1) No copiar archivos de nombre muy largos, los recorta asi nomas, perdiendo la extension

2) Tratar de desmontar manualmente la particion antes de apagar la maquina para sacar el rigido, suele colgarse en esta instancia, no pasa nada pero mas vale prevenir que curar

3) Seguro que ya lo sabian, pero con TSgui se pueden crear imagenes de rigido desde la amiga, a modo de backup... obviamente, éstas se pueden montar en linux con la opcion loop ya mencionada

Queda averiguar protocolos de red que utiliza la amiga